MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 137095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002944	TGG	2	6	55404	55409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406146
1502	NC_002944	CCG	2	6	55424	55429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406147
1503	NC_002944	GCA	2	6	55438	55443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406147
1504	NC_002944	CGGG	2	8	55465	55472	0 %	0 %	75 %	25 %	41406147
1505	NC_002944	CCA	2	6	55477	55482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406147
1506	NC_002944	GGT	2	6	55601	55606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406147
1507	NC_002944	TCG	2	6	55623	55628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406147
1508	NC_002944	GC	3	6	55650	55655	0 %	0 %	50 %	50 %	41406147
1509	NC_002944	TGA	2	6	55720	55725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406147
1510	NC_002944	ACC	2	6	55728	55733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406147
1511	NC_002944	CCG	2	6	55745	55750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406147
1512	NC_002944	CAA	2	6	55760	55765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406147
1513	NC_002944	TCG	2	6	55821	55826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406147
1514	NC_002944	TCC	2	6	55890	55895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406147
1515	NC_002944	GCC	2	6	55908	55913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406147
1516	NC_002944	CGC	2	6	55921	55926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406147
1517	NC_002944	GTG	2	6	55950	55955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406147
1518	NC_002944	CGGC	3	12	55994	56005	0 %	0 %	50 %	50 %	41406147
1519	NC_002944	CAA	2	6	56006	56011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406147
1520	NC_002944	TGA	2	6	56074	56079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406147
1521	NC_002944	CCGG	2	8	56179	56186	0 %	0 %	50 %	50 %	41406148
1522	NC_002944	TCA	2	6	56237	56242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406148
1523	NC_002944	CGC	2	6	56280	56285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406148
1524	NC_002944	CG	3	6	56292	56297	0 %	0 %	50 %	50 %	41406148
1525	NC_002944	CG	3	6	56333	56338	0 %	0 %	50 %	50 %	41406148
1526	NC_002944	GC	3	6	56359	56364	0 %	0 %	50 %	50 %	41406148
1527	NC_002944	GGT	3	9	56427	56435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406148
1528	NC_002944	GCC	2	6	56458	56463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406148
1529	NC_002944	GGTC	2	8	56465	56472	0 %	25 %	50 %	25 %	41406148
1530	NC_002944	GCC	3	9	56539	56547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406148
1531	NC_002944	CGC	2	6	56563	56568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406148
1532	NC_002944	CGG	2	6	56762	56767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406149
1533	NC_002944	CGGG	2	8	56783	56790	0 %	0 %	75 %	25 %	41406149
1534	NC_002944	CCA	2	6	56798	56803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406149
1535	NC_002944	CAC	2	6	56868	56873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406149
1536	NC_002944	TCG	2	6	56959	56964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406149
1537	NC_002944	GCG	2	6	56978	56983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406149
1538	NC_002944	CG	3	6	56994	56999	0 %	0 %	50 %	50 %	41406149
1539	NC_002944	TGC	2	6	57019	57024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406149
1540	NC_002944	C	7	7	57024	57030	0 %	0 %	0 %	100 %	41406149
1541	NC_002944	GCCG	2	8	57040	57047	0 %	0 %	50 %	50 %	41406149
1542	NC_002944	GCC	2	6	57106	57111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406149
1543	NC_002944	CGG	2	6	57113	57118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406149
1544	NC_002944	GCC	2	6	57122	57127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406149
1545	NC_002944	CGGTG	2	10	57164	57173	0 %	20 %	60 %	20 %	41406149
1546	NC_002944	TCG	2	6	57232	57237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406149
1547	NC_002944	GCA	2	6	57239	57244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406149
1548	NC_002944	CAG	2	6	57258	57263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406149
1549	NC_002944	CGC	2	6	57269	57274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406149
1550	NC_002944	TGC	2	6	57353	57358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406149
1551	NC_002944	GCA	2	6	57386	57391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406149
1552	NC_002944	CG	3	6	57444	57449	0 %	0 %	50 %	50 %	41406149
1553	NC_002944	CTC	2	6	57503	57508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406150
1554	NC_002944	CGG	2	6	57601	57606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406150
1555	NC_002944	GCG	2	6	57613	57618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406150
1556	NC_002944	ATTG	2	8	57730	57737	25 %	50 %	25 %	0 %	41406150
1557	NC_002944	GCA	2	6	57748	57753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406150
1558	NC_002944	CCG	2	6	57755	57760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406150
1559	NC_002944	CAC	3	9	57773	57781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406150
1560	NC_002944	GC	4	8	57814	57821	0 %	0 %	50 %	50 %	41406150
1561	NC_002944	GGC	2	6	57884	57889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406150
1562	NC_002944	CAT	2	6	57893	57898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406150
1563	NC_002944	GCG	2	6	57906	57911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406150
1564	NC_002944	TTG	2	6	57930	57935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406150
1565	NC_002944	GAT	2	6	57983	57988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406150
1566	NC_002944	CAC	2	6	57989	57994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406150
1567	NC_002944	GGCC	2	8	58031	58038	0 %	0 %	50 %	50 %	41406150
1568	NC_002944	CAA	2	6	58151	58156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406150
1569	NC_002944	GAA	2	6	58190	58195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406150
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1571	NC_002944	CGC	2	6	58262	58267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406150
1572	NC_002944	CGC	2	6	58271	58276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406150
1573	NC_002944	G	6	6	58292	58297	0 %	0 %	100 %	0 %	41406150
1574	NC_002944	CGC	2	6	58298	58303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406150
1575	NC_002944	CGG	2	6	58328	58333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406150
1576	NC_002944	CCA	2	6	58417	58422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406150
1577	NC_002944	TTG	2	6	58428	58433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406150
1578	NC_002944	CCA	3	9	58483	58491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406150
1579	NC_002944	CCG	2	6	58492	58497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406150
1580	NC_002944	TGG	2	6	58513	58518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406150
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1582	NC_002944	CTC	2	6	58640	58645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406150
1583	NC_002944	CAC	2	6	58658	58663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406150
1584	NC_002944	CGG	2	6	58678	58683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406150
1585	NC_002944	CAC	2	6	58721	58726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406150
1586	NC_002944	GTA	2	6	58733	58738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406150
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1588	NC_002944	CGA	3	9	58799	58807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406150
1589	NC_002944	GCG	2	6	58820	58825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406150
1590	NC_002944	CAG	2	6	58841	58846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406150
1591	NC_002944	CGA	2	6	58864	58869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406150
1592	NC_002944	CG	3	6	58901	58906	0 %	0 %	50 %	50 %	41406150
1593	NC_002944	CAG	2	6	58907	58912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406150
1594	NC_002944	GGGCG	2	10	58961	58970	0 %	0 %	80 %	20 %	41406150
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1596	NC_002944	TCG	2	6	59067	59072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406150
1597	NC_002944	GGCT	2	8	59073	59080	0 %	25 %	50 %	25 %	41406150
1598	NC_002944	GCC	2	6	59087	59092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406150
1599	NC_002944	GCA	2	6	59110	59115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406150
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1601	NC_002944	GC	3	6	59140	59145	0 %	0 %	50 %	50 %	41406150
1602	NC_002944	GCC	3	9	59160	59168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406150
1603	NC_002944	CAG	2	6	59177	59182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406150
1604	NC_002944	CGA	2	6	59186	59191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406150
1605	NC_002944	TCA	2	6	59269	59274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_002944	CGG	2	6	59295	59300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_002944	GCCC	2	8	59305	59312	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1608	NC_002944	CGC	2	6	59343	59348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406151
1609	NC_002944	ACG	2	6	59390	59395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406151
1610	NC_002944	CGGC	2	8	59396	59403	0 %	0 %	50 %	50 %	41406151
1611	NC_002944	TCG	2	6	59405	59410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406151
1612	NC_002944	GGC	2	6	59411	59416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406151
1613	NC_002944	CGG	2	6	59426	59431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406151
1614	NC_002944	ACGC	2	8	59480	59487	25 %	0 %	25 %	50 %	41406151
1615	NC_002944	CG	4	8	59488	59495	0 %	0 %	50 %	50 %	41406151
1616	NC_002944	GCA	2	6	59547	59552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406151
1617	NC_002944	GTC	2	6	59554	59559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406151
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1621	NC_002944	CG	4	8	59692	59699	0 %	0 %	50 %	50 %	41406151
1622	NC_002944	AGCG	2	8	59717	59724	25 %	0 %	50 %	25 %	41406151
1623	NC_002944	CAG	2	6	59725	59730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406151
1624	NC_002944	GTGGG	2	10	59754	59763	0 %	20 %	80 %	0 %	41406151
1625	NC_002944	CGC	2	6	59770	59775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406151
1626	NC_002944	AGC	2	6	59798	59803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406151
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